به گزارش فرهنگ امروز به نقل از مهر، تدوین و پیشنهاد سیاست‌ها، آیین نامه‌ها و مقررات پژوهشی مراکز تخصص و مؤسسات آموزش عالی و ارائه به معاونت پژوهش، برنامه‌ریزی فعالیت‌های پژوهشی مراکز و مؤسسات و ایجاد هماهنگی میان آنها، هماهنگی  با معاونت پژوهش حوزه‌های علمیه در اجرای سیاست‌ها و برنامه‌های کلان پژوهشی، ساماندهی مدارک علمی، رساله‌ها و پایان نامه‌های تحصیلی مراکز و مؤسسات آموزش عالی حوزوی در چارچوب استانداردها و اولویت‌های پژوهشی و سایر ضوابط از جمله وظایف بخش امور پژوهشی است.

در ابلاغیه آیت الله حسینی بوشهری به مواردی همچون تشکیل کمیته‌های تخصصی مرتبط با موضوعات پایان نامه‌های تحصیلی مراکز و مؤسسات آموزش عالی حوزوی، انجام امور مربوط به خدمات پژوهشی از قبیل حمایت از نشست‌ها و همایش‌های علمی، نشریات، قطب‌ها و کانون‌های علمی و کرسی‌های نظریه پردازی؛ ساماندهی امور کتابخانه‌ها و اسناد علمی مراکز تخصصی و مؤسسات آموزش عالی اشاره شده است.

از دیگر وظایف این بخش می‌توان به نظارت بر حسن اجرای کلیه امور پژوهشی و فن آوری، کتابخانه‌ها و بانک‌های اطلاعاتی مراکز تخصصی و مؤسسات آموزش عالی، مطابق  مصوبات، مقررات و آیین نامه‌های مربوطه؛ برنامه ریزی و سیاست‌گذاری به منظور ارتقای سطح همکاری‌های علمی در سطح  ملی و بین المللی؛ توسعه، تقویت و هدایت طرح‌های پژوهشی طلاب با اولویت پژوهش‌های مورد نیاز؛ کنترل و نظارت بر فرآیندهای پژوهشی مراکز تخصصی و مؤسسات آموزش عالی حوزوی؛ ارزش یابی فعالیت‌های پژوهشی مراکز تخصصی و مؤسسات آموزش عالی حوزوی اشاره کرد.

همچنین ایجاد ارتباط مناسب با مؤسسات داخلی و خارجی به منظور افزایش همکاری در امور پژوهشی و مبادله خدمات علمی، همکاری در اجرای دوره‌های کوتاه مدت و برگزاری  کارگاه‌های پژوهشی برای مراکز تخصصی و مؤسسات، تهیه و پیشنهاد آیین نامه‌های مورد نیاز پژوهشی با مشارکت مراکز تخصصی و مؤسسات آموزش عالی از دیگر وظایف بخش امور پژوهشی حوزه است.